کتاب بنیادهای فکری القاعده (تاثیرات اندیشه های وهابی-سلفی) سوال اصلی در این کتاب این است که ریشه‌های شکل‌گیری و مبانی فکری القاعده کدامند؟ برای پاسخ به این سوال چند سوال فرعی نیز مد نظر نویسنده قرار می‌گیرد از جمله، اصول فکری القاعده تا چه اندازه برگرفته از گروههای افراطی مصری نظیر الجهاد و جماعت اسلامی است؟ تا چه اندازه القاعده در مبانی فکری خود از اندیشه‌ها و آراء متفکرینی نظیر ابن تیمیه، ابوعلاء المودودی، سید قطب و دیگران تاثیر پذیرفته است؟ نقش عنصر خارجی در شکل‌گیری القاعده چه بوده است؟ بحث اصلی نویسنده بر این فرض استوار است که ریشه‌های اصلی شکل‌گیری مبانی فکری القاعده برگرفته از ایدئولوژی گروه‌های رادیکال مصری است که خود این گروه‌ها اصول فکری خود را از ابن تیمیه، المودودی، سید قطب و عبد السلام فرج گرفته اند. این آراء و اصول فکری با نقش عنصر خارجی زمینه‌های عملیاتی یافته اند. کتاب حاضر دارای یک مقدمه و سه فصل است. در فصل اول زمینه‌های ظهور جریان‌های اسلامی در دهه‌های آخر قرن بیستم به عنوان پیش در آمد شناخت کلی جریانهای اسلام گرای منطقه مورد بررسی می‌گیرد. این فصل سعی دارد تا زمینه‌های فکری القاعده را مورد شناسایی بهتر و عمیق تر قرار دهد. در واقع بستر و ریشه فکری القاعده در گروه‌های تندرو و سلف گرای منطقه و بطور خاص مصری قرار دارد. شناخت اندیشه‌های دو گروه الجهاد و جماعت اسلامی مصر و رهبران فکری آن نظیر ابن تیمیه ، ابوعلاء المودودی، سید قطب و عبدالسلام فرج سهم به سزایی در فهم مبانی سیاسی ـ ایدئولوژیک القاعده دارد. در فصل دوم چگونگی شکل‌گیری القاعده مورد بررسی قرار می گیرد. مباحثی نظیر چگونگی شکل‌گیری القاعده و ساختار آن، شرح حال رهبرانش، بستر‌های رشد القاعده در افغانستان به عنوان مهدی برای گسترش شبکه بین المللی آن، ارتباطات القاعده با جنبش و دولت طالبان و نیز ارتباط آنها با سایر گروه‌های سلفی در دنیا مورد کنکاش قرار می‌گیرد. در فصل سوم دیدگاه‌ها ، آراء و مبانی فکری وهابیت مذهبی ـ سیاسی تشریح و نوع ارتباط فکری آن با القاعده بیان می‌شود.سپس آراء و اندیشه‌های تک تک متفکرین مهم جریان‌های اسلام گرا نظیر ابن تیمیه، ابوعلاء المودودی، سید قطب و اصول فکری دو گروه سلف گرا مصر یعنی الجهاد و جماعت اسلامی مورد کنکاش قرار می‌گیرد و در یک بررسی تطبیقی به میزان تاثیری پذیری فکری القاعده از اندیشه‌های افراد یادشده می‌پردازیم. درادامه فصل سوم جهت تکمیل بحث، میزان تاثیری گذاری القاعده به طور جداگانه برسایر گروه‌های سلف گرای اهل تسنن مورد بحث قرارمی گیرد.